Co to stojí za to, moje skutečné nastavení je toto, dokud nepřijdu (nebo nenajdu) něco jasně lepšího:
lib
db
index.js
model.js
...
handler
index.js
whateverMakesSenseForMyParticularWebSite.js
...
router
index.js
model1RestRoutes.js
model2RestRoutes.js
iuRoutes.js
...
config.js (or a folder with multiple files if it makes sense)
server.js (main)
public
css
img
js
test
...
views
...
Takže ano, modely, pohledy, ale dělám samostatné cesty a skutečnou implementaci handlerů. Oddělení, vstřikování závislosti úplně. Mnohem testovatelnější/zesměšněnější.