Do toho jsem narazil také. Ukázalo se, že to může být způsobeno dvěma věcmi.
1. If the node you are adding already has its own dbData.
2. If you ran rs.initiate() on both nodes. It is only supposed to be run on the primary.
Chcete-li to vyřešit, budete muset zkontrolovat /etc/mongod.conf pro atribut "dbPath" a přesunout nebo odstranit všechny soubory v této složce.