Protože vypadáte, že dotazujete pouze podle _id
Věřím, že to dokážete:
db.NotificationA.findOne({"tag.$id": ObjectId("blah")});
Nicméně:
DBRefs nejsou JOINy, jsou pouze samy popisující _id
v případě, že neznáte propojovací kolekci, vytvoří se pomocný objekt, takže jej nemusíte kódovat sami na straně klienta.
Více o DBRefs naleznete zde:http://docs.mongodb.org/ manual/applications/database-references/
V zásadě můžete dotazovat podpole v rámci DBRef ze stejného dokumentu, tj.:DBRef.$_id
ale nemůžete na straně serveru vyřešit tento DBRef a dotazovat se na výsledná pole.