Doba provádění LINQ to SQL je 50x delší než SSMS SQL

Porovnejte možnosti SET pro SSMS a vaše relace LINQ:

SELECT * FROM sys.dm_exec_sessions
WHERE session_id in (@@SPID, @LINQSESS)

(nahraďte @LINQSESS svým ID relace Linq)

ARITHABORT je často viníkem, podívejte se, zda to váš problém vyřeší:

new SqlCommand("SET ARITHABORT ON", connection).ExecuteNonQuery();