Zažil jsem stejný problém a zjistil jsem, že to bylo způsobeno Nástroje -> Možnosti -> Průzkumník objektů SQL Server -> Skriptování -> Převést uživatelem definované datové typy na základní typy.
Když je to "Pravda", ztratím bloky komentářů. Když "False" bloky komentářů se vrátily.