Právě jsem našel odpověď v tomto vláknu:PHPMyAdmin - Celkový počet záznamů se liší
Zdá se, že přidání konfiguračního parametru do config.inc.php dělá ten trik:http://www.kavoir.com/2012/07/make-phpmyadmin-show-exact-number-of-records-for-innodb-tables.html
Stačí přidat tento řádek do souboru config.inc.php:
$cfg['MaxExactCount'] = 2000000;
Takže každá tabulka InnoDB s méně než 2000000 řádky bude mít zobrazený přesný počet řádků.
Udělejte toto číslo dostatečně velké a všechny tabulky InnoDB ve vaší databázi budou mít přesný počet řádků na stránce databáze phpMyAdmin.