Váš dotaz v kódu PHP nepřinese požadovaný výsledek, protože jste jej nastavili na Position a Secondary na stejnou hodnotu. Na základě vámi poskytnutých ukázkových dat, která nic nevrátí.
Pokud hledáte dotaz na výběr vhodných hráčů pro dropdwon, můžete dotaz změnit tak, aby vypadal takto:
SELECT * FROM `allsquads`
WHERE `Team` = '$t1select'
AND (`Position` = '$position[$i]' OR `Secondary` = '$position[$i]')