Tento problém jsem vyřešil předkompilací ovladače ODBC 17 pro SQL Server na počítači se systémem Ubuntu 18.04 a zkopírováním souboru libmsodbcsql-17.5.so.2.1 a msodbcsqlr17.rll soubory do příslušných adresářů prostřednictvím Heroku buildpack. Toto je ovladač ODBC 17.5 pro SQL Server a pravděpodobně nebudu kompilovat další verze tohoto ovladače, ale myslím si, že koncept zůstává stejný.
Stavební balíček Heroku a jeho požadavky naleznete zde https://github.com/matt-bertoncello/python-pyodbc-buildpack.git