Vyřešeno. Po testování téměř každé možné metriky výkonu a prozkoumání každého kusu kódu jsem zjistil, že chyba byla způsobena trochou zastaralého databázového kódu. Hlavní problém byl způsoben kódem používajícím:
SqlConnection.ClearPools;
Pro budoucí použití pro všechny další vývojáře, kteří chtějí ladit svůj kód a spravovat fondy připojení, vynikající zdroj naleznete zde:http://www.codeproject.com/KB/dotnet/ADONET_ConnectionPooling.aspx