Měli byste zjistit poslední timestamp
hodnoty v každé skupině (poddotaz) a poté připojte tento poddotaz k tabulce -
SELECT t1.* FROM messages t1
JOIN (SELECT from_id, MAX(timestamp) timestamp FROM messages GROUP BY from_id) t2
ON t1.from_id = t2.from_id AND t1.timestamp = t2.timestamp;