Zkuste vložit sql Connector/Driver do tomcat/lib a ne do war. Protože pokaždé, když nasadíte war, konektor/ovladač se někdy vytvoří, garbage collector je nedokáže odstranit, což skončí únikem paměti. Zkuste tedy přesunout konektor ve složce tomcat/lib.
Přečtěte si prosím následující odpovědi:
Proč musí Ovladač JDBC umístit do složky TOMCAT_HOME/lib?
Jak nakonfigurovat Tomcat pro připojení k MySQL