Jak řekli jiní, nemůžete použít příkaz source v MySQLdb Python API
Takže místo toho, abyste to spustili, načtěte soubor a spusťte jej
Řekněme, že váš soubor .sql má
create database test;
Přečtěte si obsah jako
sql=open("test.sql").read()
A pak to spusťte
cursor.execute(sql);
Získáte nový "test" databáze