Také jsem narazil na
problém pomocí následujícího příkazu
mysqlcheck -u root -p --auto-repair -c -o --all-databases
To, co jsem udělal, a je to proto, že jsem líný lol, bylo vše spouštěno samostatně a bylo použito -r pro opravu namísto --auto-repair
mysqlcheck -u root -p -r --all-databases
mysqlcheck -u root -p -c --all-databases
mysqlcheck -u root -p -o --all-databases