Myslel bych si, že to bude fungovat, ale jsem otevřený opravám:
(UPRAVENO tak, aby zahrnovalo dobrý bod uvedený v komentářích)
delete from mysql.proc WHERE db LIKE <yourDbName>;
(Jak uvedl Balmipour v komentářích níže, je dobré specifikovat databázi.)
Myslím, že je správné chtít vypustit všechny procedury v dané databázi, jinak v dlouhém vývojovém cyklu hrozí nebezpečí, že se zastaralé procedury a funkce nashromáždí a všechno zašpiní.