Změna localhost na 127.0.0.1 vyřešil můj problém pomocí MySQLdb :
db = MySQLdb.connect(
host = '127.0.0.1',
user = 'root',
passwd = '',
db = 'testdb',
port = 3000)
Pomocí 127.0.0.1 nutí klienta používat TCP/IP, takže server naslouchající TCP portu jej může vybrat. Pokud host je zadán jako localhost , použije se zásuvka nebo potrubí Unix.