Řešením je vnořit ORDER BY a LIMIT do klauzule FROM jako součást spojení. To vám umožní nejprve najít přesný řádek, který má být aktualizován (ta.id), a poté provést aktualizaci.
UPDATE tableA AS target
INNER JOIN (
SELECT ta.id
FROM tableA AS ta
INNER JOIN tableB AS tb ON tb.id = ta.user_id
WHERE tb.username = '$varName'
ORDER BY ta.datetime DESC
LIMIT 1) AS source ON source.id = target.id
SET col1 = '$var';
Kloboukový tip baronu Schwartzovi, aka Xaprbovi, za skvělý příspěvek přesně na toto téma:http://www.xaprb.com/blog/2006/08/10/how-to-use- order-by-and-limit-on-multi-table-updates-in-mysql/