Setkal jsem se s podobným problémem ve Windows 7 při instalaci mysql-connector-python-1.0.7-py2.7.msi a mysql-connector-python-1.0.7-py3.2.msi .
Po změně z "Install only for yourself" na "Install for all users" při instalaci Pythonu pro Windows "python 3.2 not found" problém zmizí a mysql-connector-python-1.0.7-py3.2.msi byla úspěšně nainstalována.
Myslím, že problém je v tom, že instalační program konektoru mysql hledá pouze HKEY_LOCAL_MACHINE položky a věci, které hledá, mohou být pod HKEY_CURRENT_USER atd. Takže řešení, které přímo změní tabulku reg, také funguje.