Je možné přidat MySQL server do SQL Serveru jako propojený server.
Jakmile to nastavíte, můžete se dotazovat pomocí OPENQUERY takto:
SELECT t1.colA, t2.colB
FROM SQLdbName.dbo.tablename AS t1
INNER JOIN OPENQUERY(MySQLlinkedservername,
'SELECT colA, colB FROM tablename') AS t2
ON t1.colA = t2.colA