Z http://dev.mysql. com/doc/refman/5.1/en/innodb-data-log-reconfiguration.html :
Innodb vytváří souborový systém ("tabulkový prostor") v rámci samotných datových souborů. Nikdy „nezmenšuje“ datové soubory, když jsou data odstraněna, protože reorganizace dat v souboru by mohla být nákladná (neexistuje žádná záruka, že odstraněná data byla na konci nebo dokonce souvislá). Opětovným vytvořením databáze, jak je popsáno výše, se soubor zvětší tak, jak je nutné pro všechna data, ale ne větší.