Nakonec jsem našel řešení a bylo to docela jednoduché...
Nejprve musím nechat mysql svázat externí adresu, takže jsem v kontejneru změnil linku bind-address na '0.0.0.0'. Dále jsem jen změnil příkazový řádek pomocí mysql -h 127.0.0.1 -P 3308 -u root -pMyPassword
Nyní je to v pořádku, mám přístup k datům kontejneru mysql z hostitele.
Díky všem za pomoc :)