Můj kód začal mít přesně tento problém poté, co provedl celosystémovou aktualizaci balíčku dne 29.3.2017 poprvé od 1.2.2017.
Při pohledu na verzování pro RMySQL,RMySQL_0.10.9.tar.gz zveřejněno 2016-05-08 15:39RMySQL_0.10.10.tar.gz zveřejněno 2017-03-21 07:50
Vrátil jsem svou verzi na 0.10.9 a problém zmizel:
require(devtools)
install_version("RMySQL", version = "0.10.9", repos = "http://cran.us.r-project.org")
Uveřejnil jsem váš problém na chybovou stránku RMySQL, tak uvidíme, zda jej vyřeší