Pro informaci, pokud někdo najde toto vlákno se stejným problémem, opravil jsem svůj problém.
Moje tovární funkce Flask App měla řádek app.app_context().push() pozůstatek z prvních dnů, kdy byl založen na výukovém programu Flask. Při restrukturalizaci projektu byla tato linka vynechána a problém se sám vyřešil. Nejste si jisti, proč nebo jak by tento řádek způsobil tento problém, a to pouze u některých, ale ne u všech požadavků.