Dotaz by měl být takový, jak je uvedeno níže, připojili jste se ke stejné tabulce, a proto problém jedinečného aliasu. Pro lepší čitelnost jsem přidal alias tabulky.
UPDATE
sales_flat_order sfo
INNER JOIN sales_flat_order_grid sfog
ON sfog.entity_id = sfo.entity_id
SET sfo.coupon_code = "newcoupon"
WHERE sfog.increment_id = "12345678" ;