Samotné ukládání do mezipaměti není dobrý důvod, proč jít s MongoDB. Jakékoli správně nakonfigurované RDBMS uloží často používaná data do mezipaměti.
Jaký aspekt MySQL aktuálně omezuje váš výkon? Máš na serveru dostatek RAM? Jsou vaše disky dostatečně rychlé? Máte zařízení s nízkou latencí mezipaměti, jako je SSD, správně nakonfigurované?