Navicat je schopen to udělat za vás. Bude také synchronizovat schéma a/nebo data mezi dvěma instancemi databáze mysql. V minulosti jsem to úspěšně používal.
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql/mysql_overview .html
Zde je snímek obrazovky nástroje pro synchronizaci dat a struktury:
http://www.navicat.com/en/products/navicat_mysql /mysql_detail_mac.html#7