SET sql_log_bin=0
je to, co hledáte. Vyžaduje SUPER priv. a vypne protokolování příkazů z vaší relace, dokud jej nenastavíte zpět na 1. Viz http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/en/server-session-variables.html#sysvar_sql_log_bin
SET sql_log_bin=0;
UPDATE ... ;
INSERT ... ;
DELETE ... ;
SET sql_log_bin=1 ;