Vložením řádku:
<property name="testQuery" value="SELECT 1"/>
v konfiguraci zdroje dat se zdá, že připojení je před použitím otestováno a znovu připojeno, pokud je mrtvé. Zkoušel jsem to s wait_timeout=60
a dokonce i při restartu MySQL-Serveru, když moje aplikace běžela...
Výsledek:žádné další výjimky a chyby!