Nemyslím si, že to, co chcete, je možné:nikdy jsem to neviděl, protože každá knihovna (PDO, mysql a mysqli) používá své vlastní připojení k Dabatase - což znamená, jak jste si všimli, že připojení vytvořená pomocí jeden z nich není sdílen s ostatními.
Předpokládám, že budete muset najít způsob, jak migrovat celý svůj kód najednou – alespoň pro části, které potřebují pracovat se stejnými transakcemi.