možnosti příkazu case rozdělené na dva výstupní sloupce

Potřebujete 2 výrazy typu CASE:

SELECT    f.id, 
          CASE WHEN id_user IS NOT NULL THEN url END url,
          CASE WHEN id_user IS NULL THEN landing_page END landing_page
FROM      funzioni f
LEFT JOIN funz_abilitate fa ON fa.id_funzione = f.id AND fa.id_user = $id

Také musíte kvalifikovat všechny názvy sloupců s názvem/aliasem tabulky, abyste se vyhnuli nejednoznačnostem.