Flask-MySQL používá MySQL-Python, který nepodporuje Python 3, a došlo k otevřený problém přes rok. Místo toho použijte Flask-MySQLdb, který používá MySQLclient.
pip install flask-mysqldb
Nebo použijte SQLAlchemy, mnohem výkonnější rozhraní pro práci s databázemi.
pip install flask-sqlalchemy mysqlclient