Odstraňte duplikáty v dotazu MySQL JOIN na JSON_ARRAYAGG pomocí INNER JOIN

To odpovídá na původní otázku.

Nepotřebujete ani tags ani users tabulku pro váš dotaz, takže ji lze výrazně zjednodušit.

DISTINCT není povoleno s JSON_AGG() . Můžete ale použít poddotaz:

 SELECT b.user_id, JSON_ARRAYAGG( b.tag_id) AS tags
 FROM (SELECT DISTINCT b.user_id, bt.tag_id
       FROM bookmark_tag bt JOIN
            bookmark b 
            ON b.id = bt.bookmark_id
      ) b
 GROUP BY b.user_id;

Zde je db<>hudlík.