Měl jsem přesně stejný problém, jaký jste nahlásili. Moje připojení ODBC používalo ovladač MySQL ODBC 5.3 Unicode Driver (/usr/local/lib/libmyodbc5w.so) I když jsem se mohl připojit k iSQL, skutečné příkazy SQL vracely odpad.
Zkusil jsem změnit svůj odbc.ini tak, aby místo toho používal ovladač ANSI (/usr/local/lib/libmyodbc5a.so). Fungovalo to a RODBC se nyní může připojit k mé databázi MySQL.