Podle dokumentace PropertyValueException, pokud nastavíte hodnotu null ve vlastnosti deklarované not-null="true" a poté se ji pokusíte přetrvat/aktualizovat, dostanete tuto výjimku.
Viz http://docs.jboss.org/ hibernate/orm/3.5/javadoc/org/hibernate/PropertyValueException.html
Měli byste odstranit atribut not-null="true" z konfigurace (protože výchozí hodnota not-null je false) a poté by databáze měla vložit výchozí hodnotu, kterou jste zadali v konfiguraci (v tomto případě '1 ').
[AKTUALIZACE]
Raději bych to uvedl jako komentář v odpovědi fujy, ale zatím nemám povoleno komentovat jiné odpovědi. Funguje to podle očekávání, pokud odstraníte atribut 'not-null' (jak ukazuji níže)? Věřím, že to je to, co způsobuje výjimku, kterou dostáváte.
<property name="isActive" type="java.lang.Short">
<meta attribute="default-value">1</meta>
<column name="IsActive" />
</property>