Ukázalo se, že jde o problém s tcp_connect_timeout mezi aplikačním serverem a databázovým serverem. Časový limit připojení tcp byl výchozí 1 hodina a moje nastavení recyklace bazénu bylo 3 hodiny. Takže cokoliv mezi 1 a 3 selhalo. Zveřejněním odpovědi pomůžete ostatním, kteří se s tím mohou později setkat.