Nevím, jak importujete soubory CSV, ale způsob, jakým bych to udělal, je napsat skript (php/perl), který přečte každý soubor, zaokrouhlí nahoru nebo ořízne časové razítko na sekundy a provede příkazy INSERT na DATABÁZI.
Něco jako
<?php
$file=fopen("your.csv","r");
mysql_connect ($ip, $user, $pass);
while(!feof($file))
{
$line = explode(',',fgets($file));
mysql_query("INSERT INTO TABLE1 (ID, DATE) values (".$line[0].", ".substr($line[1],0,19).")");
}
fclose($file);
?>
Spusťte to z příkazového řádku a mělo by to provést úlohu