V současné době bude MySQL provádět všechny výběry na sjednocení, i když je v prvních několika dotazech dostatek řádků, jak ve své odpovědi zmínil @Yuki Inoue. Pomocí odpovědi @user1477929 můžete svůj dotaz přepsat jako:
(SELECT a FROM t1 WHERE a=10 AND B=1 LIMIT 1000)
UNION ALL
(SELECT a FROM t2 WHERE a=11 AND B=2 LIMIT 1000)
UNION ALL
(SELECT a FROM t3 WHERE a=12 AND B=3 LIMIT 1000)
ORDER BY a LIMIT 1000;
což vám dá maximálně 1000 řádků a nikdy nenaskenujte více než 3000.