Pomocí Eloquent můžete provést následující:
$match = "
match (
`title`,
`description`
) against (
?
IN BOOLEAN MODE
)";
$against = 'bar';
$sql->whereRaw($match, array($against));
$sql->orderByRaw($match . " DESC", array($against));
Totéž by fungovalo s Query Builderem, ale pak musíte udělat trochu přepsání.