MyISAM je rychlejší, když je dotaz jednoduchý, ale je mnohem pomalejší ve vysoce souběžném prostředí jako jeho zámek na úrovni tabulky ve srovnání se zámkem na úrovni řádků InnoDB.
Tabulka MyISAM se může jednoduše stát hotspotem a zpomalit každý připojovací dotaz, takže se jí raději vyhněte.