Narazil jsem na stejný problém SQLite/Postgres s Flask a SQLAlchemy, podobně jako Gordon Fierce. Moje řešení však bylo jiné. Postgres je přísný, pokud jde o uzamčení tabulek a připojení, takže explicitní uzavření připojení k relaci při teardown mi problém vyřešilo.
Můj pracovní kód:
@pytest.yield_fixture(scope='function')
def db(app):
# app is an instance of a flask app, _db a SQLAlchemy DB
_db.app = app
with app.app_context():
_db.create_all()
yield _db
# Explicitly close DB connection
_db.session.close()
_db.drop_all()
Reference:SQLAlchemy