Našel jsem řešení problému. Umístěním protocolVersion=2 do adresy URL JDBC v podstatě říká ovladači Postgres JDBC, aby nepoužíval příkazy připravené na straně serveru. To umožňuje, aby moje aplikace běžela při používání PGPool II před mojí databází. Vadí mi, že se musím vrátit k protokolu JDBC verze 2, jen abych mohl používat PGPool.