jak zabránit duplikátům s dotazem na vnitřní spojení (Postgres)

V tomto případě je možné použít distinct před join možná, že bude výkonnější:

select fb.* 
from
    formulation_batch fb
    inner join
    (
        select distinct formulationbatch_id
        from formulation_batch_component
        where component_id in (1, 2)
    ) fbc on fb.id = fbc.formulationbatch_id 
where fb.project_id = 1

Všimněte si, jak použít alias pro názvy tabulek, aby byl dotaz jasnější. Také pak in operátor je velmi šikovný. Použití dvojitých uvozovek s těmito identifikátory není nutné.