Když spustíte knex migrate:latest a knex seed:run , funguje to, protože váš soubor knexfile.js je umístěn na stejné úrovni jako váš soubor .env ve vašem systému souborů. To znamená, že vaše proměnné prostředí jsou správně importovány.
Je váš soubor acl.js na stejné úrovni? Pokud ne, možná byste měli spustit node /path/to/acl.js z .env úroveň.