Oprava Flyway za vás neopraví vaši databázi (viz dokumenty zde ). To, co dělá, je oprava tabulky historie schématu zpět do platného stavu. Oprava databáze je ponechána na uživateli (protože jde o netriviální úkol).
V této situaci můžete zkusit odeslat commit;
. To by vám mělo umožnit spustit opravu a poté znovu migrovat. Viz:https://dbaclass.com/article/ora-12838-cannot-readmodify-object-modifying-parallel/