Proveďte GROUP BY , použijte COUNT (který počítá pouze nenulové hodnoty):
select id,
count(value1) as value1,
count(value2) as value2,
count(value3) as value3
from table1
group by id
Upravit :
Pokud hodnoty nejsou null, ale '.' (nebo něco jiného), použijte case výrazy pro podmíněné počítání, něco jako:
select id,
count(case when value1 <> '.' then 1 end) as value1,
count(case when value2 <> '.' then 1 end) as value2,
count(case when value3 <> '.' then 1 end) as value3
from table1
group by id