Většinou je to důsledek časových limitů s dlouhým čtením/zápisem.
zkuste prodloužit časové limity nebo je úplně odstranit:
MongoClientOptions.Builder options_builder = new MongoClientOptions.Builder();
options_builder.maxConnectionIdleTime(<some_long_time>);
MongoClientOptions options = options_builder.build();
MongoClient mongo_db = new MongoClient ("your.db.address", options);