Problém je vyřešen. Problém byl v tom, že mám v souboru application.yml více profilů a nedeklaruji název databáze v profilu heroku, takže načítal název databáze z výchozího profilu. Pod souborem application.yml
spring:
data:
mongodb:
database: pizza-store
uri: mongodb://localhost:27017
price-point-multiplier : 0.1
---
spring:
profiles: docker
data:
mongodb:
database: pizza-store
uri: mongodb://mongodb:27017
---
spring:
profiles: heroku
data:
mongodb:
uri: ${MONGODB_URI}