Vím, že je to staré, ale narazil jsem na tento problém a narazil jsem na tuto otázku. Podařilo se mi to vyřešit.
Můj problém byl na Ubuntu 18.04 a při pokusu o instalaci a spuštění MongoDB 3.4/3.6.
Jedním problémem byl chybějící adresář /var/run/mongodb s příslušnými oprávněními, druhým byla tato chyba. Stále si nejsem 100% jistý, zda tato chyba souvisela s adresářem nebo ne, ale určitě to mělo něco společného s konfiguracemi.
Můj mongod.conf skončil s processManagement - fork nastaveným na true. Změna na hodnotu false umožnila, aby začal fungovat.