Není to GreaterThan to způsobuje váš problém, je to skutečnost, že filtr je ve vnořeném poli. Váš filtr na doc_type funguje, protože není vnořený. To je zjevně problém s motorem Catalyst ve Sparku, ne s konektorem Mongo. Ovlivňuje také predikátové sesuvy v, např. parketách.
Další podrobnosti najdete v následujících diskuzích v Spark Jira.