dotaz mongodb podle podpole

Zkuste:

db.XXX.find({ "_id.module" :  "B" });

Rozdíl je v tom, že váš původní dotaz by se snažil najít shodu v celém tomto vnořeném dokumentu (tj. kde _id je vnořený dokument obsahující pole „modul“ s hodnotou „B“ a nic jiného)

Reference:Tečkovaná notace MongoDB