Rozdíl mezi časy dotazů by měl být téměř zanedbatelný, protože oba omezují hranice jedinečného _id, takže budou nalezeny okamžitě. Jediný nepatrný náskok zde vede k count protože db vrátí int místo celého dokumentu. Takže čas, který ušetříte, je čistě kvůli přenosu dat z db do klienta.
Jak již bylo řečeno, pokud je vaším cílem vytvořit existuje dotaz a o data se nestaráte, použijte count